As bacias hidrográficas de domínio federal representam as bacias que possuem áreas em mais de um Estado da federação. No caso do Maranhão, estas áreas estão representadas pelas bacias dos rios: Parnaíba (Maranhão e Piauí), Tocantins (Maranhão e Tocantins) e Gurupi (Maranhão e Pará). No que diz respeito às porções destas bacias inseridas no Maranhão, em conjunto, elas representam uma área de 113.068,15 km², ou seja, 34,06% do território maranhense. A figura 15 apresenta as áreas totais das bacias hidrográficas do Estado do Maranhão.
Bacia Hidrográfica do Parnaíba
A bacia hidrográfica do rio Parnaíba é a maior dentre as bacias federais maranhenses, possui uma área de 66.449,09 km², representando cerca de 20,02% da área total do Maranhão. Esta bacia tem cerca de 19,5% de sua área localizada no Estado do Maranhão. A bacia do Parnaíba consiste na parte maranhense da região hidrográfica nacional do Parnaíba, ocupando, no Maranhão cerda de 19,8% dessa região hidrográfica.
O rio Parnaíba, que é o divisor natural entre os Estados do Maranhão e do Piauí, nasce na Chapada das Mangabeiras, em altitudes de aproximadamente 800m, onde recebe a denominação de rio Água Quente. Após percorrer cerca de 1.400 km chega à sua foz, no Oceano Atlântico, onde forma o grande delta do Parnaíba ou delta das Américas.
Dentre os seus principais afluentes está o rio Balsas, que nasce no ponto de encontro da Chapada das Mangabeiras, e o riacho da Limpeza que nasce na Serra do Penintente. O rio Balsas tem extensão de aproximadamente 525 km, é perene em todo o seu trecho até desaguar no rio Parnaíba a 12 km, a montante, das sedes municipais de Benedito Leite (MA) e Uruçuí (PI) (Figura 16).
Bacia Hidrográfica do Tocantins
A bacia hidrográfica do rio Tocantins no Estado do Maranhão possui uma área de 30.665,15 km², representando cerca de 9,24% da área total do Estado. Esta bacia tem cerca de 9,0% de sua área localizada no Maranhão. A bacia hidrográfica do rio Tocantins representa a parte da área da região hidrográfica do Araguaia-Tocantins inserida no Estado do Maranhão. Sua delimitação equivale ao limite entre os Estados do Maranhão e Tocantins, ou seja, na maior parte é o Rio Manuel Alves Grande, um dos principais afluentes do Rio Tocantins, e na outra parte é o próprio rio Tocantins até a sua confluência com rio Araguaia (Figura 17 e Figura 18)
Bacia Hidrográfica do Gurupi
A bacia hidrográfica do rio Gurupi, pelo lado do Estado do Maranhão, possui área de 15.953,91 km², representando cerca de 4,80% da área total do Estado. Esta bacia tem cerca de 70% de sua área contida no Maranhão.
O rio Gurupi, rio de domínio federal, é o divisor natural entre os estados do Maranhão e do Pará. Este rio nasce em terras maranhenses, na serra do Gurupi, entre os municípios de Açailândia e São Francisco do Brejão, percorre terreno de baixada em direção Norte, com uma extensão 720 km, até chegar ao Oceano Atlântico. Destacam-se como afluentes maranhenses do rio Gurupi, os rios Surubim, Tucumandiua, Cajuapara, Panemã, Apará e Jararaca. O principal divisor de águas da bacia hidrográfica do Gurupi com as bacias hidrográficas do Mearim e Turiaçu é a Serra do Tiracambu (Figura 19).
Fonte: www.nugeo.uema.br